第一個例子便是德國的薔薇十字會，其成立於1600年。
薔薇十字會尋求的完全在於整合所有的人類知識，將神秘學與科學融合成一門哲學，然後傳授于底下的成員。
薔薇十字會將學習點歸入三本手冊，這三本冊子分別作於1614年、1615年和1617年，但作者不詳，其名曰Fama Fraternitatis Sosae Crucis（著名的薔薇十字會）、Condessio Fraternitatis Rosae Cruis（薔薇十字會的聲明）、以及The Chemical Wedding of Christian Rosenkreutz（克利斯蒂安·羅森克洛茲的化學婚禮），這些書冊說的是克利斯蒂安·羅森克洛茲在1407年創立了神秘學社團。
克利斯蒂安·羅森克洛茲是一名煉金術士，
他到過埃及、巴勒斯坦、摩洛哥菲斯，他在哪些地方學習了古老的神秘主義哲學並獲得啟迪。在The Chemical Wedding中，羅森克洛茲被說成是具有魔力的，他創造了一個人造新娘和一個人造新郎，並通過煉金術中偉大工作的方式使他們結婚、死亡，以及復活。
根據第一本手冊的說法，羅森克洛茲的智慧源于古埃及的傳統。由於對那裡的習俗制度不滿，所以便來到了德國並創建了協會來繼續傳播這一傳統。
羅森克洛茲于106歲時去世，他被會友埋入墳墓並將協會的秘密一同帶了進去，這些秘密直到1604年在他的墳墓重新打開時才得知。根據手冊上的描述，羅森克洛茲的墳墓有七間墓室，頂上有一輪太陽。牆壁上佈滿了魔法符號，墓室中間有一個石頭祭壇，當祭壇打開時就會發現羅森克洛茲一直未腐爛的軀體。
雖然這些都是協會在手冊上通過圖像的描述，
但是很多人都認為是真的。為了回應這股熱情，薔薇十字會成立了。總的來說，薔薇十字會實踐的是煉金術，但僅僅只局限於煉金術的精神層面，而非實驗室裡在物質上的實踐。但是他們開創了將精神上的目標與科學結合的嘗試。他們在許多方面都提供了一種介於宗教與科學之間的方式，這應該是受到當時的科學名人的影響，如牛頓（1571－1630），不但發明了萬有引力理論同時還是一名煉金術士；還有開普勒（1571－1630），
提出了行星運動的三大定律，但他同時也是一名占星術士。當時也認為是說成立於1660年的“倫敦皇家協會”——當時世界上第一家科學組織之一——就是效仿薔薇十字的理念而建立的，致力於在哲學人士群體中共用知識，不過也就是在皇家協會中分成了科學與宗教。
在17世紀，歐洲的宗教同樣還是分為天主教和新教兩大派。雖然起初新派並不為天主教庭接受，
但薔薇十字會卻提供了一種中間的說法，即靈性的追求比宗教派別更重要。薔薇十字會員們認為，他們的哲學信奉的是自古以來所有古老科學和教派都有表達的數字和幾何上的神聖真理。他們相信這種真理都有在古老的建築名作中呈現，比如埃及金字塔和所羅門神殿。牛頓，舉世聞名的科學家，當時也有花了大把的時間對所羅門神殿在精神層面的意義做了研究，發現所羅門神殿就是一種“曼陀羅”（神秘主義者用於冥想的具有暗示性的神秘圖形），其代表了精神世界，訴說了創造的過程。到了18世紀，牛頓的研究有了成果，他的這種成果深深影響了其後的一個新的神秘學組織——共濟會。 發現所羅門神殿就是一種“曼陀羅”（神秘主義者用於冥想的具有暗示性的神秘圖形），其代表了精神世界，訴說了創造的過程。到了18世紀，牛頓的研究有了成果，他的這種成果深深影響了其後的一個新的神秘學組織——共濟會。